jinnian金年会官方网站入口Drugbank:最强壮的归纳性药物数据库保藏

2021-09-20 21:36:44 来源:jinnianhui金年会官网 作者:jinnian金年会官网

  DrugBank数据库是阿尔伯塔大学将具体的药物数据和全面的药物方针信息结合起来,实在牢靠的生物信息学和化学信息学数据库。DrugBank包含13791种药物条目,其间包含2653种经同意的小分子药物、1417种经同意的生物技术(蛋白质/肽)药物、131种营养品和6451种试验药物。此外,5236个非冗余蛋白(即药物靶标/酶/转运体/载体)序列与这些药物条目相关联。每个DrugCard条目包含200多个数据字段,其间一半用于药物/化学数据,另一半用于药物靶标或蛋白质数据。

  。DrugBank能够供给关于药品,药品靶点和药物效果的生物或生理成果的具体、最新、定量分析或分子量的信息。②

  。供给计算机检索药物、药物“康复”、计算机检索药物结构数据、药物对接或挑选、药物代谢猜测、药物靶点猜测功用。DrugBank

  其间Chemical structure答应用户制作(运用Marvin Sketch小程序或Chem Sketch小程序)或写下(SMILES字符串)化合物,右侧能够设置检索类似值等,对结构式进行含糊检索,能够找到与方针结构式附近的药物。

  主页的查找包含四种,分别为“Drugs(药品名)”、“Targets(靶点)”、“Pathways(效果途径)”、“Indications(适应症)”,因为篇幅的原因,以下对Drugs进行介绍吧。

  这儿能够看到对药物的称号、描绘、类型、结构体同位素、化学式等内容,比方这儿描绘提到吗啡是鸦片的首要生物碱,于1805年初次从罂粟种子中取得。是一种有用的止痛药,虽然因为耐受性,戒断和乱用危险而受到限制。吗啡在1941年取得FDA同意。

  这部分会给出吗啡在运用过程中和其他药物的相互效果和结果展现,以及一些食物的忌讳。

  后边还有临床试验、药物制作各大公司集团、价格以及专利的介绍,靶点等等,在结构栏能够看到,具体内容这儿不再逐个列出。

  东西,能便利咱们检索到新的药物靶方针、比较药物结构、研讨药物机制以及探究新式药物。

  阅读模块能够让咱们挑选小分子药物或许生物技术药物,挑选项包含是否同意(Approved)、保健品(Nutraceutical)、违禁药(Illicit)、研讨药物(Investigational)、撤回药物(Withdrawm)、试验药物(experimental)。最重要的是,许多药物在各个国家的运用情况是不一样的,因而,DrugBank供给了药物运用地分组,能够挑选归于美国,加拿大仍是欧洲的商场。

  阅读的组织依据药物的称号、分量、结构体和药物描绘以及分类目录进行展现,示例如下:

  PS:蛋白质辨认符包含UniProt和PDB等资源的外部ID。这些下载首先按蛋白质/化合物类型(靶标,转运蛋白等)区分。其次,它们按毒品类别(同意的,不合法的等)区分。每个档案包含2个文件:一个用于一切靶标/酶/转运蛋白/载体,一个仅带有标记为的文件pharmacologically active(与至少一种相关药物的效果机制直接相关)。导出CSV文件中的每一行还包含一连串的DrugBank药品ID(以分号分隔)的列表作为最终一列。

  凭借Drugbank 数据库,能够协助咱们赶快的了解疾病相关药物的信息,检查相应的成分、产地和价格,挑选所需药物,为下一步试验进行仿制药or新药的研制或许相关研讨都有必定的协助。以上便是本期内容,祝我们运用愉快~

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